《江苏海洋大学学报（自然科学版）》刊登文章以海洋科学与技术、水产类学术论文为主，同时兼顾药学、数理科学、机械工程、电子工程、计算机工程、化学工程、食品工程、土木工程、测绘工程等学科论文。本刊是美国《化学文摘》（CA）、俄罗斯《文摘杂志》（AJ）、美国《乌利希期刊指南（网络版）》（UPD）、《日本科学技术振兴机构数据库（中国）》（JSTChina）及《中国学术期刊综合评价数据库》《中文科技期刊数据库》《中国核心期刊(遴选)数据库》《中国学术期刊（光盘版）》《万方数据库——数字化期刊群》等检索系统收录源期刊。
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